学院成立于1953年5月，前身为座落于乌市西北路国营新疆运输公司驾训队
1954年定名为国营新疆运输公司驾训大队，校址乌市黄河路。
1956年迁至昌吉州吉木萨尔县三台镇。
1958年学校定名为国营新疆运输公司工人训练队，迁址在乌市老满城。
1960年定名为新疆交通厅汽车驾驶学校，校址乌市八户梁，1962年，学校撤销。
1964年，创办交通局驾训大队，校址米泉县十三户。
1968年，文化大革命期间停办。
1974年，学校恢复，更名为新疆交通技工学校。
1982年，创办新疆交通学校。
1985年，新疆交通技工学校与新疆交通学校分校独立办学，1997年，两校又重新合并。
2004年，升格为新疆交通职业技术学院。
